Tujuan Kampus FAI Medan adalah mengembangkan diri menjadi lembaga unggulan di bidang studi agama Islam dan pelatihan komprehensif dalam lingkungan Sumatera Utara. Agar mengimplementasikan hal, institusi berusaha meningkatkan sumber daya untuk pemantapan kualitas pengajaran, pengembangan infrastruktur, dan penguatan kerja sama bersama seluruh pihak